在天体汇聚的时刻再次到来之际，院灵玛勒基斯企图摧毁九大国度，缔造一个全然黑暗的宇宙。
在一次政治要人遭到暗杀后，工系过湖所有的矛头又一次指向变异人。一个拥有很高声誉的前将军，列两率领着反对变异人的联盟连续对x教授施压。
项软协金钢狼的身世也将在本集中进一步揭开。第一集中，通鉴定变异人在X教授的指挥下，将邪恶的万磁王打入冷宫，但是依然得不到社会的承认。万磁王在这种情况下，北省不得不寻找与X教授联手抵抗前将军的方式
在得知幻影猫（艾伦·佩吉EllenPage饰）利用穿越时空的能力帮助Blink（范冰冰饰）等战友逃脱巨型机器人哨兵的追杀后，勘察X教授（帕特里克·斯图尔特PatrickStewart饰）和万磁王（伊恩·麦克莱恩IanMcKellen饰）达成认同，勘察决定让金刚狼（休·杰克曼HughJackman饰）穿越回1973年，找到年轻的X教授（詹姆斯·麦卡沃伊JamesMcAvoy饰）和年轻的万磁王（迈克尔·法斯宾德MichaelFassbender饰）并说服他们一起阻止魔形女的行动。故事的设定发生在当下，设计变种人族群遭到了前所未有的毁灭性打击，设计而这一切的根源是魔形女瑞文（詹妮弗·劳伦斯JenniferLawrence饰）在1973年刺杀了玻利瓦尔·特拉斯克（彼特·丁拉基PeterDinklage饰）。
于是，院灵金刚狼踏上了回到过去的旅程，但是命运会不会发生逆转，任何人都无从知晓
最终，工系过湖肖被查尔斯和埃里克合力消灭。天云的公司也大有起色，列两并且天云与张协理产生感情。
项软协原来他被自己曾经施过恩的罗吉所救。如今，通鉴定他们对扫毒组组长林光南有所顾忌。
北省天云发现仓库中有毒品。在艾伦的帮助下，勘察罗吉抓到了叶洋，使刘长荣得以洗清，于是刘长荣通知两个儿子来见他。
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